杭州BD单细胞实验平台

单细胞获得困难，不同组织要求不尽相同难以搞定？烈冰2000+项目消化经验，100+组织类型解离protocol，精心设计不同组织实验的解离、细胞悬浮实验体系，确保单细胞的获得。冻存样本无法实验，珍贵样本无法使用？烈冰采用国际认可的冻存组织复苏技术以及死细胞过滤技术，确保冻存组织使用。珍贵样本，细胞数量太少，消化背景杂无法做单细胞？采用国际认可的10XGenomics，BDRhapsody双平台模式，根据样本实际情况和用户需求提供客观有效的实验方案,细胞量少，背景杂也能做单细胞。单细胞RNA分类精度不足，部分细胞无法细分？烈冰同时采用单细胞蛋白质组与单细胞转录组测序技术，真正做到从上游到下游的全流程检测，确保超高的细胞分类精度。基于磁珠Barcode和UMI及polyT的探针结构，精细区分上万个细胞中mRNA的来源及表达丰度。杭州BD单细胞实验平台

如在现有研究方法基础上，进行特定亚细胞区域的蛋白质组学、相互作用蛋白质组学以及某种特定翻译后修饰类型的蛋白质组学的研究等。这将有助于诸多生化过程以及致病机理的全新认识与发现。随着基于单细胞蛋白质组学质谱研究方法的不断发展，单细胞分析方法的灵敏度、蛋白质的覆盖度、细胞通量、空间分辨率以及多组学的兼容能力会不断突破我们的认知极限。更重要的是，单细胞分析在临床诊断、疾病分型以及细胞发展机制这些重大生命科学领域方面的应用将会越来越大。杭州BD单细胞转录组测序自2019年起，烈冰生物BD单细胞测序平台已助力发表近20篇一区CNS高分文章。

科研的魅力之处，在于无穷尽的探寻生命的本底，通过单细胞测序，我们对组织的分子基础的研究也从初级到深层，并在单细胞层面逐渐达成一致，那么不禁要问一句，组织的空间位置到底重不重要？空间异质性是功能的关键特征，细胞的位置信息更能反应细胞命运调控机制和细胞谱系发生过程。因此时间和空间即像组织的AB面，而不可否认的是，此时空间坐标的记录，像一个还未长大的娃娃，虽未触及分子基础研究的深层，但仍在努力攀登探寻生命本底的下一个高峰。

从单细胞测序描述性分析转向复杂样本中不同细胞类型的功能解析，越来越需要一种多组学的细胞生物学视角。通过单细胞多组学——即对不同组学的数据集进行分析和整合——科学家能够从同一个单细胞来源中检测多种细胞特征。这些特征包括全转录组基因表达、细胞表面蛋白表达、免疫组库序列（包括T细胞和B细胞受体）以及用于了解表观基因组调控的开放染色质区域。随着单个实验可提供更多信息丰富的数据，研究人员的获益更多，包括保留珍贵样本、提高生产力、减少因批次效应引起的错误，并节省更多的高科技资源（从资助基金到人员时间）。BD 单细胞捕获平台搭配BD Scanner，全流程实时质控，项目质量尽在掌握。

关于单细胞测序实验样本制备，这与流式细胞术用户熟悉的步骤完全一致，也就是通过酶促或机械消化、细胞分选或其他细胞分离技术从整个样本中制备生成活的单细胞悬液。随后是细胞计数和质量控制步骤，以确保您的样本有适当浓度的活细胞，并且不含细胞团块和死细胞碎片。如有必要，您还可以使用抗体对样本进行染色，标记细胞表面蛋白或其他生物分析物，或者通过FACS来富集感兴趣的细胞类型。解离样本时采取的具体步骤将根据您的起始材料和实验目标而定。也许需要额外的制备步骤，具体取决于组织质量、样本丰度、细胞大小，以及是否需要提取出细胞核进行染色质可接近性分析。无论具体的考虑因素如何，所有样本类型都遵循同一个基本原则，那就是生成高质量的单细胞悬液。丰富的测序和数据分析经验，烈冰配套全程个性化、定制化地数据分析服务。武汉单细胞平台

2019年，烈冰已助力发表了采用BD Rahpsody平台的单细胞风湿类文章。杭州BD单细胞实验平台

针对单细胞测序的细胞数量判断环节：主要是对细胞数量、基因表达量、测序质量进行整体描述。过滤标准：由于细胞破碎后游离RNA会释放到环境或孔中，并且测序中也会存在一些死细胞，导致数据存在background值。因此，我们需要设定一定的标准来过滤掉假细胞或死细胞。以10×Genomics为例，细胞数量判断主要通过分析UMICounts-Barcode曲线斜率拐点，当存在多个斜率拐点的时候，结合预期UMI=500时的细胞数量进行过滤。当斜率拐点低于UMI=500的时候，选择UMI=500作为细胞的判断的标准；否则，选择和预期细胞数量接近的拐点作为细胞判断的位置。这样我们能够有效获得真实的并且在基因数量上可以分析的数据。杭州BD单细胞实验平台

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